Современные собаки произошли от двух популяций волков из разных частей Евразии В широкомасштабной работе Grey wolf genomic history reveals a dual ancestry of dogs (Геномная история серых волков показывает двойное происхождение собак), опубликованной в журнале Nature в соавторстве с зарубежными и российскими коллегами было проанализировано 72 генома древних волков, охватывающих последние 100 000 лет в истории Европы, Сибири и Северной Америки, в т.ч. образцы древних волков из коллекции Музея мамонта СВФУ. Серые волки (Canis lupus) оставались широко распространенными в течение последнего ледникового периода, когда многие другие крупные виды млекопитающих вымерли. Происхождение собак (Canis familiaris) от серых волков (Canis lupus) не вызывает вопросов, причем одомашнивание произошло во время ледникового периода, по крайней мере, 15 000 лет назад. Однако остается загадкой, где, когда и как произошло одомашнивание и мало, что известно об истории и возможном вымирании прошлых популяций волков или о том, когда и где жили волчьи прародители современной линии собак (Canis familiaris).
Анализ ДНК древних волков и современных и древних собак показал, что одомашнивание волков могло произойти дважды: на востоке и на западе Евразии. В плейстоцене разные популяции волков активно взаимодействовали между собой, что, вероятно, обеспечило выживание вида в период оледенения. Исследователи проанализировали 72 генома волков, проживавших в последние 100 тысяч лет в Европе, Сибири и Северной Америке: 67 геномов они секвенировали сами и добавили к анализу еще пять, секвенированных ранее. Останки, послужившие источником древней ДНК, были собраны палеонтологами и археологами 38 научных учреждений из 16 стран. В частности, в исследование вошли мумифицированные тушки Туматских щенков, обнаруженные в Усть-Янском районе Якутии в 2011 и 2015 годах, из коллекции Музея мамонта СВФУ, а также голова волка, жившего примерно 32 000 лет назад, и щенок Догор, погибший около 18 000 лет назад. Оба экземпляра обнаружены в Абыйском районе Якутии в бассейне р. Индигирки в 2018 году. Все эти палеонтологические объекты, за исключением головы волка, который находится в ведении Академии наук РС(Я), изучаются в рамках международного научно-исследовательского проекта СВФУ «Плейстоценовые и последниковые псовые из вечной мерзлоты Якутии».
Полученные данные сравнили с геномной информацией по современным волкам, древним и современным собакам и другим видам псовых. Ученые обнаружили, что генетическое сходство выше между собаками и древними волками из Азии, чем между собаками и европейскими волками. Это позволило сделать вывод, что одомашнивание происходило в восточной части Евразии. Более того, оказалось, что предки собак принадлежали двум популяциям. Первые собаки из северо-восточной Европы, Сибири и Америки, вероятно, происходили от волков восточноевразийской или центральноевразийской популяции. В геномах же первых собак Ближнего Востока, Африки и южной Европы отмечался вклад волков из западной Евразии.
Ученые предложили два возможных варианта развития событий, объясняющих полученные результаты. Согласно первому, восточные и западные предки собак были одомашнены независимо друг от друга и позже объединились на западе. Второй предполагает одомашнивание животных только восточной популяции волков. После этого первые собаки смешивались с дикими волками западной популяции, и так появились собаки Африки и Ближнего Востока. Но в любом случае имело место слияние предков около 7,2 тыс. лет назад — это возраст самого древнего из доступных генома ближневосточной собаки.
Авторы впервые отследили естественный отбор у крупного животного в масштабе 100 тысяч лет, то есть на протяжении примерно 30 тысяч поколений и наблюдали эволюцию в реальном времени, а не пытались реконструировать ее по современной ДНК. Сейчас исследователи собирают геномы волков с территорий, не охваченных этой работой, включая более южные регионы.

https://www.nature.com/articles/s41586-022-04824-9
Anders Bergstrom, David W. G. Stanton …, Sergey Fedorov,…, Love Dalen & Pontus Skoglund Grey wolf genomic history reveals a dual ancestry of dogs (Геномная история серых волков показывает двойное происхождение собак) Nature 607, pages 313–320 (2022) https://doi.org/10.1038/s41586-022-04824-9 WoS Q1